隨著市場需求多樣化，機床制造商往往提供同一種機床可配置多種數控的選擇或數控系統中多種選擇功能的選擇。
機床制造商提供的機床配置的數控系統分為主流系統及可適應的系統，主流系統相對來說技術成熟性好一些，但對使用用戶應另有要求，例如對系統的質量追求、希望在國內有較好的售后技術條件、在用戶單位使用的數控系統相對集中在幾家等要求，以便使用掌握和維修配件準備，所以用戶單位都愿意配置自己信得過或比較熟悉的數控系統。
在可供選擇的系統中性能高低差別很大，直接影響到設備價格構成，因此不能片面追求高水平、新系統，而應以滿足主機性能為主，對系統性能和價格等作一個綜合分析，選用合適的系統。目前世界上比較著名的數控系統有日本的FANUC、德國的SINUMERIK、法國的NUM、意大利的FIDIA、西班牙的FAGO和美國的A-B等。各大機床制造廠商也有自己的一些系統，如MAZAK、OKUMA等。國內也有航天集團、機電集團、華中理工大學、遼寧藍天、南京大方集團、北方凱奇等數控系統供應商，每家公司也都有一系列的各種規格的產品。

用戶選擇系統的基本原則是：性能價格比要高、購后的使用維護要方便、系統的市場壽命要長（不能選淘汰系統，否則使用幾年后將找不到維修備件）等。
數控系統中除基本功能以外還有很多可供選擇的功能。對配在機床上的系統，由于機床使用基本要求所需的數控系統選擇功能已由制造商選配，用戶可以根據自己的生產管理、測量要求、刀具管理、程序編制要求等，額外再選擇一些功能列入訂貨單中，如DNC接口聯網要求等。